【摘 要】
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中国林蛙(Rana chensinensis)是一种名贵的中药财,有研究证明"林蛙油"和林蛙皮具有多种营养和药用价值,同时其皮肤也是生产多种抗菌肽的良好资源。林蛙油为雌性林蛙膨大的输
【机 构】
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濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院; 生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院;
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中国林蛙(Rana chensinensis)是一种名贵的中药财,有研究证明"林蛙油"和林蛙皮具有多种营养和药用价值,同时其皮肤也是生产多种抗菌肽的良好资源。林蛙油为雌性林蛙膨大的输卵管,是传统滋补品,林蛙皮可直接入药。为了研究林蛙不同组织的基因表达以及从基因层面探索林蛙各部位的药用价值,本研究分别对林蛙的输卵管、肠、胃等多个组织共45个样品使用RNA-seq进行了转录组测序,使用De Novo的方式完成了中国林蛙转录组的组装,产生了1,085,532条转录本序列,得到一个较为完整的中国林蛙转录组。功能注释在NR,Swiss-Prot,KEGG,COG和GO等5个公共数据库中分别注释到247,668(22.82%),194,620(17.93%),115,785(10.67%),113,311(10.44%)和12,320(17.49%)条转录本,综合多个数据库结果后共计注释了327,867(30.20%)条转录本。基于表达量比较分析鉴定出输卵管组织与其他组织间共计600多个差异表达基因,这些基因显著富集在了多个与免疫反应相关的GO条目。本研究的中国林蛙多组织基因表达数据为今后林蛙药用价值开发提供了基础数据。
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