2009~2010年北京儿童腹泻中轮状病毒新VP4基因亚型的研究

来源 :病毒感染与儿科消化系统疾病专题研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:azhan
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  目的:P[8]b基因亚型是国内外新近发现的A组人轮状病毒(HRV)VP4基因的一种新亚型。建立有效鉴别HRV P[8]a, P[8]b,P[4]及P[6]基因(亚)型的VP4基因打点杂交分型方法。方法:通过对GenBank序列数据库可检索到的国内外HRV各种P基因型及P[8]b亚型的VP4基因序列应用DNAStar和Meglign软件进行VP4基因分析,在不同基因型别间核昔酸变异密集而相同P基因型内核昔酸高度保守的的位置设计各型别探针,并分别以本实验室上传GenBank的北京HRV地方株常见基因(亚)型P[8]a, P[4], P[6]及新近发现的P[8]b亚型的VP4基因作为相应型别探针的合成引物的设计模板及探针经PCR合成的合成模板,合成地高辛素标记的DNA探针。结果:经测序验证所建立的VP4基因杂交分型方法结果特异、无交叉杂交及反应背景。对门诊88例(55%, 88/160)及住院79例(70.5%, 79/112) HRV腹泻患儿的P分型结果显示P[8]a亚型仍为主要型别,前者为%.6%(85/88),而后者为62.0%(49/79);P[8]b亚型在住院HRV感染腹泻患儿中占较高比例(27.9%, 22/79),且其在门诊HRV感染患儿中也存在,但仅占2.3%, (2/88);本组标本中HRV P[8]b亚型主要与G9型组合。此外单纯P[4]基因型HRV感染仅在住院腹泻患儿中检测到I例((1.3%, 1/79),而P[6]基因型在门诊及住院HRV感染腹泻患儿中均未检测到。结论:本研究建立的VP4基因杂交分型方法是特异、可靠的,是对经典巢式PCR分型方法的一个有效的改进和补充。
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