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真核细胞中,mRNA 和大多数snRNA 的转录是由RNA 聚合酶Ⅱ(RNA Pol Ⅱ)完成的.酵母的Pol Ⅱ 由12 个亚基组成,分子量从8kDa 到200kDa 不等.Pol Ⅱ大亚基Rpb1 的C-末端比Pol Ⅰ和Pol Ⅲ 多出一个CTD 结构域,它是由7 个氨基酸YSPTSPS(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser)构成的重复多肽串联而成.