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回顾中医基础理论研究近几十年来的研究现状，包括主要的研究内容、研究方向、研究方法和总体的研究思路，以及从事中医药研究的学者们对对中医基础理论近几十年来的发展所提出的困惑和质疑。采用文献计量学的方法对1999-2008年这十年中医基础理论的文献进行统计，分析中医基础理论研究的活跃区域，热点内容，研究方法等方面，提出具有文献依据的中医基础理论发展概况。并对中医基础理论研究发展过程中的迁延变化，以及未来的发展思路进行初步的探讨。