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本文基于克雷伯杆菌的全基因组序列、大肠杆菌的全基因组序列及酿酒酵母的全基因组序列，通过相对同义密码子使用度(RSCU)和相对同义密码子使用频率(RFSC)参数，确定它们各自的偏好密码子与高频密码子。结果表明，这三者的偏好密码子都为25个，且都偏好以TAA为终止信号。可知，克雷伯杆菌具有其独特的密码子偏性，与物种的亲缘关系类似，该偏性跟大肠杆菌比较差异较小，而与酿酒酵母差别极大，密码子优化时可依据它们各自的偏性进行有目的的同义密码子替换；另外可知，高频密码子集合是偏好密码子集合的子集，相对偏好密码子而言，通常数量更少、特异性更高的高频密码子，其对异源表达中密码优化问题的参考价值可能更高。