【摘 要】
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南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black streaked dwarf virus,SRBSDV)是呼肠孤病毒科(Reoviridae)斐济病毒属(Fijivirus)2组的一个新种。由该病毒基因组S9编码的P9-1是
【机 构】
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南京农业大学植物保护学院分子植物病毒实验室;
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南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black streaked dwarf virus,SRBSDV)是呼肠孤病毒科(Reoviridae)斐济病毒属(Fijivirus)2组的一个新种。由该病毒基因组S9编码的P9-1是个病毒质蛋白,本文采用琼脂糖凝胶迁移阻滞试验(Electrophoretic mobility shiftassay,EMSA)在体外初步分析SRBSDV P9-1蛋白结合单链RNA的生化特性。非变性蛋白胶及凝胶阻滞分析结果表明SRBSDV P9-1蛋白在自然状态下形成多种多聚体类型,其中,八体构型蛋白是蛋白存在及蛋白结合单链RNA的主要形式;丙氨基酸替换实验结果表明N端带正电荷氨基酸R26、R39、K43、K44是蛋白结合单链RNA的主要位点,并且与C端末尾23个氨基酸一样都影响蛋白八体的形成;与SRBSDV同科同属的水稻黑条矮缩病毒(Rice black streaked dwarf virus,RBSDV)编码的P9-1蛋白同样是一个病毒质蛋白,两者都包含347个氨基酸,最大的差异存在于131~160位残基序列,氨基酸交换实验表明SRBSDV P9-1的131~160位氨基酸残基并不能拯救RBSDV P9-1形成更多的八体蛋白,反而减弱了RBSDV P9-1结合单链RNA的活性;这些结果表明仅有RNA结合位点但不具备蛋白八体构型将不能有效结合单链RNA,而只有当蛋白构象与结合位点同时存在并相互匹配时,蛋白结合RNA的活性才达到最大。
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