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为探究黑松家系的遗传多样性，本实验采用限制性片段长度多态性(Amplified Fragment Length polymorphism)分子标记技术对51份黑松家系进行遗传多样性的分析.9对引物对51份黑松家系扩增后检测出1125条谱带，其中有1122条多态带，平均多态带比例为99.73％，表明所试黑松材料具有较高的遗传多样性.分析统计黑松家系的特异性条带有220条，包括一条缺失带，通过特异性条带可将90％的黑松家系鉴别出来.聚类分析将黑松种质分成5组，来源相同的家系并未严格聚在一起，表明黑松家系的变异与地理来源没有严格的相关性.本研究为在分子水平上更为深入地了解黑松遗传背景和遗传结构提供了参考，也为种质鉴别、分子标记辅助育种中亲本选择提供了借鉴.