四株不同宿主来源的Class I基因3型新城疫病毒全基因组序列测定及比较分析

来源 :2012第四届中国兽药大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:AFI123456
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  为了解析基因型相同但宿主来源不同的新城疫病毒的全基因组差异。本文采用RT—PcR方法分别获得4株(JS/3/09/Ch,ZJ/3/10/Ch,AH/2/10/Du,JS/9/08/Go)Class I基因3型病毒的全基因组核苷酸序列,并与GenBank中已公布的Class I基因3型病毒全基因组序列进行比对分析。本实验4株病毒的基因组长度均为1 5198bp,在基因组1607—1608位有6碱基的缺失,在2 381~2 382位有12碱基的插入,裂解位点为112EQ/RQE/GRL117是标准弱毒特征。5株Class I基因3型病毒之间全基因组同源性超过93%;而与cla ss II弱毒株同源性最低只有72,2%;比较6个结构蛋白基因的同源性,NP基因的同源性最高(98.3%~96.4%),而P基因最低(96.1%~91.9%)。结果表明不同宿主来源的Class I基因3型新城疫病毒在遗传信息方面差异不大,但NP/F/L基因的变异幅度较P/M/HN基因明显。
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