【摘 要】
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利用二代测序平台对来自非洲、亚洲、欧洲、中东、美洲等不同地区的狼、狗进行了高覆盖的全基因组测序,产生了36个犬科动物的高质量全基因组数据,结合已经公布的犬科动物
【机 构】
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四川大学生命科学学院InstitutdeBiologiaEvolutiva(CSIC-UnivPompeuFabra),Barcelona,Spain成都大熊猫繁育研究基地DepartmentofEc
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利用二代测序平台对来自非洲、亚洲、欧洲、中东、美洲等不同地区的狼、狗进行了高覆盖的全基因组测序,产生了36个犬科动物的高质量全基因组数据,结合已经公布的犬科动物基因组,进行了较深入的比较基因组学分析。通过对基因组水平的杂合度分析发现,中国狼中的两只西藏狼表现出很低的杂合度。用5Mb大小的窗口扫描了所有38个染色体,计算所有5Mb窗口内的杂合度,进一步发现两只西藏狼的低杂合度表现在所有染色体。用PSMC模型对个体进行有效种群大小在历史变化分析,两只西藏狼在大约55,000年前出现了严重的瓶颈效率,并一直保持低于其它狼的有效种群大小持续到现在。
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