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在反硝化抑制硫酸盐还原菌的研究中，对厌氧硫酸盐还原污泥和反硝化污泥的DGGE图谱进行了优化，研究了硫酸盐污泥DNA的提取方法，应用通用引物958F/1401R扩增16SrDNA序列，探讨了不同的退火温度对DGGE指纹图谱多样性影响，同时采用时间进程法对DGGE图谱进行优化。结果表明，采用PBS洗涤污泥和超声震荡有利于硫酸盐还原污泥DNA提取；采用958F/1401R为引物时，扩增片段大约500 bp，不同的退火温度对DGGE指纹图谱的多样性影响不显著；采用时间进程法可以很好地再现不同电泳阶段对样品的分离效果，最佳变性剂梯度为40％～600％，在130V电压下，最佳电泳时间为5h。