大熊猫犬冠状病毒S基因的扩增、克隆与序列分析

来源 :第六次人畜共患病学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:konami_13
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从重庆某动物园死亡的大熊猫肝脏中分离到一株病毒,经鉴定为犬冠状病毒(命名为CCV DXMV).本实验根据CCV K378和CCV Insavc-1株基因序列设计合成了普通PCR引物SF<,1>-SR<,1>和SF<,2>-SR<,2>,以及半套式引物SF<,3>-SR<,3>、SRI<,3>、SFI<,3>、SF<,4>-SR<,4>和SFI<,4>,分段扩增了CCV DXMV 81-1 166位以外的S基因,得到了368bp、792bp、737bp、1 178bp和985bp 5个基因片段.将纯化的RCR产物分别克隆到pGEM-T载体中,通过筛选和鉴定,获得了S基因的克隆质粒,将阳性重组粒送生物公司测序.将CCV DXMV和其它株CCV及TGEV HN2002和FIPV 79-1 146的全S基因序列进行分析比较,并绘制了进化树.结果表明,该株病毒与CCV K378的同源性最高,达到99.4﹪;而与CCV 23/03的同源性最低,为56.9﹪;与FIPV和TGEV分别有90.4﹪和82.1﹪的同源性.
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