【摘 要】
：
目的：分离鉴定幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)临床菌株,分析其CagA蛋白的磷酸化基序EPIYA,探讨东亚株H.pylori cagA序列的结构特点. 方法：选取胃相关疾病患者的
【机 构】
：
贵阳医学院分子生物学重点实验室,贵州贵阳550004
【出 处】
：
第四届吴宪吴瑞国际学术研讨会、第九届全国医学生物化学与分子生物学、第六届全国临床应用生物化学与分子生物学联合学术讨论会
论文部分内容阅读
目的：分离鉴定幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)临床菌株,分析其CagA蛋白的磷酸化基序EPIYA,探讨东亚株H.pylori cagA序列的结构特点. 方法：选取胃相关疾病患者的胃黏膜组织,剪碎后接种于哥伦比亚血琼脂平板,微需氧培养,菌落生长后通过尿素酶实验、革兰氏染色、显微镜检对菌株进行初步鉴定,提取菌落基因组,PCR扩增H.pylori 16S rRNA基因进行测序鉴定；扩增cagA基因全长序列,连接入pMD 18-T载体,将重组质粒转入感受态E.coli DH5 α,测序鉴定重组质粒DNAStar和MEGA 6软件对cagA序列进行比对及聚类分析.结果：成功分离H.pylori共计26株,构建pMD 18-T/cagA克隆载体后,完成26株cagA基因全长测序,通过序列比对和聚类分析,发现有6株表现为西方型,20株为东亚型,东亚型CagA第815～834位点存在13个氨基酸的缺失、部分缺失或变异,西方型中有3株丢失磷酸化位点EPIYA-C.聚类分析显示分别聚类为东亚群、西方型东亚群以及西方群三群. 结论：分离的H.pylori以东亚株为主,但也存在西方株感染；东、西方型CagA在EPIYA基序及侧翼序列有明显差异,菌株之间存在明显聚类关系.
其他文献
The red-eared slider (Trachemys scripta elegans) is a worldwide invasive species.Field studies conducted in Nanjing, Guangdong, and Hainan of China, using t
鸟类孵化期胚胎的健康发育所需要的环境条件,会使亲鸟的自身维持活动受到限制,导致亲鸟在后代投入与自身维持之间产生冲突.黑颈鹤是一种终生生活在高原的鸟类,受高海拔复
Demonstration of a phage-derived peptidic self-assembly targeting two receptors in different geometries Peptide complexation with siRNA forming different ge
Herpers simplex virus (HSV) is one of the common viruses which can infect human, and it is prevalent all over the world.HSV can be divided into two serotype
Placental trophoblast cells differentiate into invasive trophoblasts or syncytiotrophoblasts.Abnormal trophoblast invasion results in pregnancy-associated d
目的:在大鼠肺泡巨噬细胞系NR8383细胞中验证IFN-γ对Toll样受体2(TLR2)表达的高调作用.方法:首先用不同浓度(0、25、50、1 00 ng/ml)的IFN-γ刺激NR8383细胞,24h后收取其总R
The structural and functional protein VP1 of echovirus is important for echovirus infection.Three antigen epitope-riched fragments of VP1 proteins from thre
目的：全基因组关联分析(GWAS)研究所鉴定的肿瘤相关的SNP几乎都处于非基因编码区域,并且尚难以评判这些SNP可能的功能及其影响.有些SNP处于基因的增强子区域,进而会影响靶
By using publicly available expression profiling data in lung cancer and integrating bioinformatics analyses, we screened out a H3K27-acetylation-activated
目的:阐明大鼠巨噬细胞NR8383中TGF-β上调TLR2表达的分子机制.方法:用10 ng/mL TGF-β刺激NR8383细胞24小时后,用RT-qPCR和Western blotting检测TLR2 mRNA和蛋白质的表达;用