牙鲆(Paralichthys olivaceus)性腺转录组分析

来源 :“全球变化下的海洋与湖沼生态安全”学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:corydalis
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  牙鲆是我国重要的海水养殖经济鱼类,其雌性个体明显大于雄性个体,外界环境因子与遗传因子共同决定影响其性别,目前关于其性别决定及分化机制仍不清楚,更多的性别相关基因挖掘和性别相关的信号通路构建将为牙鲆性别决定机制的揭示奠定基础.本研究对牙鲆Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期卵巢和卵子,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期精巢和精子、精液雌雄分别进行混样建库,采用Illumina Solexa平台进行测序,雌雄性腺文库测序分别获得22,478,374和20,161,959个reads,共同拼接得到97,233个contigs,其中21,697个contigs得到注释,并进行GO分析和KEGG通路图的构建,其中参与信号转导,细胞生长与凋亡,内分泌的基因较多,根据RPKM值和显著性分析(DEGseq,an R package),筛选得到2193个雌性高表达基因和887个雄性高表达基因,其中有21个雌性高表达和13个雄性高表达性别相关基因,包括cyp19a,dmrt1,foxl2等研究报道较多的性别相关基因和在鱼类中鲜有报道的h2a.x,zar1,fem1c,wee2,sox8a,sox6b等基因,此外还在KEGG分析中构建出性激素合成,雌激素作用信号,Wnt信号通路等性别相关的代谢合成以及信号转导通路.在性腺中集中表达的基因大多与性腺发育,配子发生,性激素合成紧密相关,并由这些基因参与组成一系列的代谢合成以及信号转导通路完成对这些发育事件的调控,本研究为进一步解析牙鲆及其它鱼类性别分化机制提供了基础数据资源.
其他文献
本文利用中国气象局国家气象信息中心研发的CMA Land Data Assimilation System(CLDAS)大气近地面强迫资料,驱动美国国家大气研究中心(NCAR)系列通用陆面模式(CLM3.5),对中国
基于甘肃省及周边地区46个气象站点的气温和降水年值、月值、日值数据,对数据进行均一化检验和订正后,利用气候倾相率法、Mann-Kendall法、EOF法对甘肃省近50a的气候变化时空
应急避难场所是应对突发公共事件的一项灾民安置措施,是现代化大城市用于民众躲避火灾、爆炸、洪水、地震、疫情等重大突发公共事件的安全避难场所.美国和日本等发达国家具有
基于多尺度多机制的研究框架,研究贵州省2000-2012年区域发展差距的尺度效应、时空演化与动力机制.研究发现,通过尺度效应分析,发现贵州省发展差距呈现下降趋势,发展差距随尺
高铁时代“时空压缩”效应产生的大客流,是推动乡村旅游转型升级与多功能景观网络构建的重要驱动力.以智慧旅游与创意农业相结合的创新发展方式,是高铁时代乡村旅游转型升级
较高的降水集中,即强降水日数降水量在降水总量中占较高的比例,很可能对水资源造成巨大的影响.以年及四季为时间尺度,利用1961-2010年广西91个常规气象观测站逐日降雨量数据,
We successfully conducted the first high-resolution near-seafloor magnetic survey of the Central,Southwest,and Northern Central Basins of the South China Sea (S
会议
在南海的演变过程中,中生代晚期到新生代早期是一个非常重要的阶段,该阶段承接晚中生代边缘汇聚,开启新生代南海裂谷和扩张.东沙及附近海区陆续发现了厚层中生代地层、高磁异
会议
Late Cenozoic basaltic rock is the main rock type of South China Sea (SCS) seamount and surrounding areas,including Macclesfield,Reed Banks,Indonesia,Thailand,V
会议
  大坝建设与水库修建是人类活动的产物,数千年来它们提供了诸如防洪、发电、航运、灌溉各方面的社会服务.但是,筑坝蓄水改变了区域温室气体源汇通量,并潜在地对全球气候产