【摘 要】
：
目的:通过分析不同嗜性B亚型HIV-1感染者V3区氨基酸序列差异,探讨V3区11、22、25位点与辅助受体使用及病人疾病进展的相关性. 方法:从HIV数据库中以FASTA格式下载B亚型V3
【机 构】
：
哈尔滨医科大学附属第一医院检验科,黑龙江哈尔滨150001
【出 处】
：
第三届东北三省暨内蒙古自治区免疫学学术会议
论文部分内容阅读
目的:通过分析不同嗜性B亚型HIV-1感染者V3区氨基酸序列差异,探讨V3区11、22、25位点与辅助受体使用及病人疾病进展的相关性.
方法:从HIV数据库中以FASTA格式下载B亚型V3区氨基酸序列,并将其分为R5亲嗜性组和X4亲嗜性组,利用CLUSTAL W软件分别对两组序列进行多重序列比对,计算每个位点氨基酸出现的频率,并进行降幂排列.采用APSSP2方法对不同亲嗜性的V3区consensus序列进行二级结构预测.
结果:研究结果显示R5亲嗜性和X4亲嗜性病毒中V3区Consensus序列在11、22和25位上具有差别.在R5亲嗜性毒株中这三个位点最常出现的氨基酸频率分别为71.9％S,66.7％A和56.0％D;在X4亲嗜性毒株中这三个位点最常出现的氨基酸频率分别为50.0％R,57.1％T和26.2％Q.在R5亲嗜性毒株中,302个S(71.9％),12个R(2.9％)和106个其他氨基酸(25.2％)出现在V3区的第11位;280个A(66.7％),126个T(30.0％)和14个其他氨基酸(3.3％)出现在V3区的第22位;235个D(56.0％),31个Q(7.4％)和154个其他氨基酸(36.7％)出现在V3区的第25位.在x4亲嗜性毒株中,21个R(50.0％),8个S(19％)和13个其他氨基酸(31.0％)出现在V3区的第11位;12个A(28.6％),24个T(57.1％)和6个其他氨基酸(14.3％)出现在V3区的第22位;4个D(9.5％),11个Q(26.2％)和27个其他氨基酸(64.3％)出现在V3区的第25位.V3区22氨基酸残基与病人CD4+T细胞数具有明显的相关性.R5亲嗜性或X4亲嗜性毒株V3区22位氨基酸残基的改变可能改变其二级结构,并向X4亲嗜性或R5亲嗜性毒株V3区的二级结构转变.
结论:研究结果发现在B亚型的HIV-1中V3区22位氨基酸残基与病毒的亲嗜性及病人的疾病进展具有明显的相关性.
其他文献
目的:探讨天然化合物20(S)-人参皂苷Rg3体外对多发性骨髓瘤U266细胞增殖抑制、诱导凋亡的作用及分泌IL-6的影响. 方法:利用MTT、流式细胞仪检测20(S)-人参皂苷Rg3对U266细
仅在一年前，平板显示器对传统的阴极射线管（ＣＲＴ）监视器还不构成任何威胁，而今情况有变，液晶显示（ＬＣＤ）已强龙出头。随着价格趋向合理化和笔记本电脑用ＬＣＤ订单下降，ＬＣＤ厂商已开始计划推动液晶显示器
目的:观察应用细胞因子诱导杀伤细胞(cytokine-induced killer cells,CIK)联合FOLFOX方案化疗治疗结肠癌的临床疗效.
方法:结肠癌患者25例,其中11例(联合治疗组)给予FOLF
屋面防水痼疾即渗漏问题其根本原因主要体现在材料方面,设计方面,施工及现场管理等方面.对于这一系列产生的问题,要提高建筑屋面防水工程的质量,材料是基础,设计是前提,施工
好多年以前,在经常和同事及朋友用扑克打拱猪和升级娱乐的时候,偶尔对能记载文化现象、定格风土人情、承载历史变故和不同风格品质的娱乐纸牌扑克产生兴趣,有意无意间开始收
目的：文献表明大肠杆菌麦芽糖结合蛋白(maltose-binding protein,MBP)能增强病原菌亚单位疫苗的免疫原性,我们前期研究发现MBP增强了MUC1的免疫原性和抗肿瘤活性,提示MBP
随着国家经济的发展和人民生活水平的提高,越来越多的人开始关注生活环境和自然环境,逐步开始认识到绿色工业对人类发展的持续意义.轻工机械行业一直以来都是工业领域中的高
四大名绣:四大名绣是苏、粤、湘、蜀四绣。苏绣是苏州地区的代表性刺绣,特点是图案秀丽,针法灵活,绣工精致。其技巧表现为“平、光、齐、匀、和、顺、细、密”八个字。粤绣
在这个“全民欠睡”的时代，睡商高低已经成为衡量一个人身体是否健康的重要标志。现在，轮到你了，请试着回答以下的问题来推断你的睡商吧： “睡商”这一概念最早由美国提出，这是美国国家睡眠基金会曾经进行的一次全国性睡商测试，可以帮助我们了解更多有关睡眠的知识。这是有关睡眠的12个观点。请判断其正误。 睡眠时，大脑在休息。对 错 如果睡眠低于需要量1～2小时，第二天的行动总受到一些影响。对 错 即使
随着互联网技术的飞速发展,企业对信息化系统的需求越来越多,系统的迭代更新也越来越迅速.同时,目前我们的软件系统体系结构主要是C/S(即Client/Server)结构和B/S(即Browser/