齐兴肉兔IGF-I基因多态性及其与生长性状的相关性分析

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本试验利用MassARRAY单核苷酸多态性质谱基因分型法,对齐兴肉兔IGF-I基因多态性进行研究,并与生长性状进行相关性分析,以期获得对齐兴肉兔生长性状有显著影响的多态位点,选育出生长性状优良的基因型个体,为下一步的新品种选育提供参考。试验选取同一日龄断奶的齐兴肉兔67只,由四川省畜牧科学研究院种兔场提供,在相同饲养管理条件下饲养。84日龄时,耳静脉采血2 mL,EDTA抗凝,-20℃冰箱保存备用。利用试剂盒,提取血样中的DNA。使用NanoDrop2000仪器进行OD值检测,1.25%琼脂糖凝胶电泳检测,DNA质检合格后,转移至96孔板,然后使用Agena MassArray技术进行基因分型。采用Excel统计基因型数据,运用SAS软件进行关联分析。结果表明:利用MassARRAY技术对齐兴肉兔67个样本的IGF-I基因的5个SNPs进行基因型分型,通过质谱软件统计分析得到了分型结果,在齐兴肉兔中该5个SNPs均具有多态性,即SNP1(T4384G)、SNP2(T5083C)、SNP3(T5399C)、SNP4(A17134G)、SNP5(T17910C)。SNP2位点T→C突变和SNP3位点T→C突变与齐兴肉兔断奶重、72日龄重显著相关(P<0.05),TC基因型个体的断奶重显著高于CC基因型个体,TT基因个体的72日龄重显著高于CC基因型个体,极显著高于TC基因型个体;在SNP5位点T→C突变与齐兴肉兔断奶重、56日龄重显著相关(P<0.05),TT基因型个体的断奶重显著高于CC基因型个体,TT基因型的56日龄重极显著高于CC基因型个体。结论:齐兴肉兔IGF-I基因3’端非编码区T5083C、T5399C、T17910C突变与断奶重有显著相关(P<0.05),T17910C突变与56日龄重有显著相关(P<0.05),T5083C、T5399C突变与72日龄重有显著相关(P<0.05)。此结果可以为齐兴肉兔的选育提高以及新品种培育提供较为准确的参考依据。
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