牙髓干细胞血管方向诱导后LncRNA的差异表达

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目的:有研究称长链非编码RNA (Long noncoding RNA,LncRNA)这一类不具有翻译蛋白功能的RNA分子存在于绝大多数细胞中,而LncRNA在牙髓干细胞(DPSCs)中的作用尚不清楚,将DPSCs向血管方向诱导,并探索其在这个过程中LncRNA的差异表达。方法:将DPCs分为两组,一组为常规培养,另一组使用血管诱导培养基。然后,我们通过检测40173个LncRNA探针和20730个编码mRNA的基因芯片对两组细胞进行了对比研究。最后,我们用qRT-PCR方法对基因芯片的结果进行了验证。结果:可发现有376个LncRNA出现显著上调表达,有426个LncRNA出现下调表达(fold change>2.0或<-2.0,P<0.05)。利用基因芯片技术检测DPSCs成血管前后mRNA表达水平,结果显示成血管诱导后上调表达mRNA共629个,下调表达的mRNA共529个(fold change>2.0或<-2.0,P<0.05);通路分析表明,52条信号通路参与了DPSCs的血管向分化过程。上调mRNA与32条信号通路相关,下调mRNA与20条信号通路相关(P<0.05)。qRT-PCR验证基因芯片的结果,结果显示与基因芯片的结果一致。结论:本研究重点研究了DPCs的血管向分化,对今后调控牙髓-牙本质复合体的形成提供新的调控位点。
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