目的：评价针灸治疗功能性腹泻的有效性并对文献进行质量评价。方法：通过计算机检索2000-2010年维普、中国知网、PubMed 数据库关于针灸治疗功能性腹泻的随机对照临床研究文献，选择符合要求的随机对照试验（RCT）、临床对照试验（CCT），采用RevMan4.2软件进行Meta分析。结果：共纳入19 篇随机对照临床研究的文献，共1888例患者，经Meta分析结果显示，针灸治疗功能性腹泻的总有效率与药物组相比，有极其显著性差异[RR=1.21，95％可信区间（1.17，1.26），Z=10.19，P＜0.00001]；针灸治疗功能性腹泻的止泻时间与药物组相比具有极其显著性差异[OR=-27.45，95%可信区间为（-33.22，-21.67），Z=9.32，P＜0.00001]；针灸治疗功能性腹泻后的症状积分与药物对照组相比具有极其显著性差异，[OR=-3.19，95%可信区间为（-3.84，-2.54），Z=9.58，P＜0.00001]。结论：针灸治疗功能性腹泻疗效肯定，针灸治疗功能性腹泻的总有效率、止泻时间、症状积分较药物对照组更为明显。但由于RCT、CCT文献数量过少，特别是高质量、大样本、多中心的随机临床研究报道较少，且文献发表存在偏倚，缺乏随机、盲法、不良反应、随访方面的报道，其临床有效性尚缺乏充分依据，因此需要进一步深入研究。