【摘 要】
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为获得钝吻黄盖鲽微卫星位点,实验采用Roche 454 GS FLX新一代平台测序技术通过(AC) 12、(AG) 12、(AAT) 12、(AGG)8、(AGC)8、(AGAT)8和(ACAG)6等7种探针,建立SSR样本文库.结果显示,5641个微卫星位点中有247种多态性位点,其中完美型占52.22％,非完美型占20.24％,复合型占27.54％；重复次数在10次以上的占总数的87.5％；随
【机 构】
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上海海洋大学,上海201306;中国水产科学学院黄海水产研究所,青岛266071 中国水产科学学院
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为获得钝吻黄盖鲽微卫星位点,实验采用Roche 454 GS FLX新一代平台测序技术通过(AC) 12、(AG) 12、(AAT) 12、(AGG)8、(AGC)8、(AGAT)8和(ACAG)6等7种探针,建立SSR样本文库.结果显示,5641个微卫星位点中有247种多态性位点,其中完美型占52.22％,非完美型占20.24％,复合型占27.54％；重复次数在10次以上的占总数的87.5％；随机选取11个位点的微卫星引物,对群体进行遗传多样性分析,得到的平均等位基因数目、平均观望杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)以及平均多态性信息含量(PIC)分别是5、0.5882、0.7882和0.67.研究表明,454 GS FLX提供了一种直观、高效开发微卫星的方法.
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