【摘 要】
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目的：在直肠癌DNA甲基化组学与表达谱检测的基础上筛选直肠癌发生发展相关的甲基化标志物.材料与方法：收集6对直肠癌及其配对的癌旁正常直肠粘膜组织,利用Illumina 450K be
【机 构】
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哈尔滨医科大学附属第四医院,150001
【出 处】
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第十二届全国大肠癌学术会议暨江苏省第九届腹腔镜外科会议
论文部分内容阅读
目的：在直肠癌DNA甲基化组学与表达谱检测的基础上筛选直肠癌发生发展相关的甲基化标志物.材料与方法：收集6对直肠癌及其配对的癌旁正常直肠粘膜组织,利用Illumina 450K bead chip高分辨率甲基化芯片对其进行全基凶组差异甲基化位点分析,同时联合应用Illumina Human HT-12 v4 Expression Bead Chip对其进行表达谱分析.利用生物信息学软件对得到的高通量数据处理后,筛选可能的直肠癌标志物,应用MS-HRM法对临床样本进行验证.结果：全基因组甲基化分析得到癌与正常组织间差异甲基化位点18568个,其中高甲基化位点7632个,低甲基化位点10516个；癌伴转移与不伴转移间差异甲基化位点997个,其中高甲基化位点749个,低甲基化位点248个.表达谱分析发现癌与正常组织间差异表达基因1934个,其中高表达基因1161个,低表达基因773个.甲基化与表达谱联合分析并筛选共得到可能的目的基因36个,已经有相关报道其中10个基凶甲基化状态的改变与大肠癌的发生相关,12个基凶与其他肿瘤的发生有关.本课题组选取了其中尚未报道与直肠癌有关的基因以MS-HRM法对44对直肠癌临床样本进行甲基化状态的验证分析,发现其与直肠癌的发生显著相关(P＜0.001).结论：本研究表明,表达谱芯片所得到的直肠癌DNA甲基化与表达谱数据对研究直肠癌的发生有重要意义,对直肠癌的早期临床诊断以及进一步筛选直肠癌肿瘤标志物也有重要应用价值.
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