【摘 要】
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本研究在斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)中克隆了干扰素调节因子10 (Interferon regulatory factor 10,IRF10)基因序列,并检测其在poly(I∶C)刺激和细菌感染情况下的表达变化.斜带石斑鱼IRF 10(EcIRF 10)基因由8个外显子和7个内含子组成,其cDNA序列全长为1776 bp,其5UTR(untranslated region
【机 构】
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集美大学水产学院,福建厦门 361021
【出 处】
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第七届全国石斑鱼类繁育与养殖产业化论坛
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本研究在斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)中克隆了干扰素调节因子10 (Interferon regulatory factor 10,IRF10)基因序列,并检测其在poly(I∶C)刺激和细菌感染情况下的表达变化.斜带石斑鱼IRF 10(EcIRF 10)基因由8个外显子和7个内含子组成,其cDNA序列全长为1776 bp,其5UTR(untranslated region) 99bp,3UTR480bp,开放阅读框长度为1197 bp,编码398个氨基酸.其在氨基端有一个高度保守的DNA结构域,在羧基端有一个干扰素调控因子结合结构域.序列相似性比对结果显示其与牙鲆IRF10的同源性和相似性最高,为79.39％和83.1％.荧光定量PCR分析显示poly(I∶C)刺激和副溶血孤菌感染均能显著上调EcIRF10表达,且poly(I∶C)刺激后EcIRF 10表达上调倍数高于细菌刺激组.此外,通过对脊椎动物基因组数据库进行搜寻,我们发现IRF10存在于大多数脊椎动物中,但在灵长类和啮齿类基因组中发生了丢失.系统进化分析结果表明脊椎动物IRF家族的第一次歧化可能出现在脊椎动物和文昌鱼进化歧化之前,产生IRF (1/2/11)和IRF (4/8/9/10)[(3/7)(5/6)]祖先,第二次或第三次分化发生于软骨鱼类与脊椎动物祖先分化之前,形成了现有的脊椎动物IRF家族的构成.
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