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我国学术期刊的主要问题可以提炼归纳为学术期刊办刊理念问题、学术期刊源流问题、学术期刊认定问题、学术期刊市场问题、学术期刊国际化竞争和数字化发展问题以及学术期刊运行模式问题。这些问题已经极大地影响了我国学术期刊的健康发展。学术期刊管理体制机制创新是一个箭在弦上的命题，关键要以促进我国学术发展为目标，要高度重视相关组织机构职责的重新确定划分和管理责任的落实和追究，还要与事业单位等多部门多系统的改革创新同步推进。