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本研究所用荆江麻鸭、靖西麻鸭等9个地方鸭品种均由国家级水禽种质资源基因库(江苏泰州)提供，根据GeneBank和已发表文献上的鸭、部分鹅和鸡的微卫星序列和引物进行筛选，三色荧光PCR产物送至上海英骏生物技术公司，基于ABI-3730XL DNA Analyzer全自动测序仪平台进行STR分型。利用GeneMapper4.0软件读取基因型。利用Microsatellite-Toolkit软件检验输入等位基因数值和片段长度间隔的正确性，统计等位基因数(NO)，计算有效等位基因数(Ne)、多态信息含量(PIC)和期望杂合度(He)，并导出FSTAT格式和Dispan格式文件;分别利用FSTAT程序与Dispan程序将生成的文件导入，计算群体内近交系数(Fis)、群体间遗传距离(DA);再以DA遗传距离为依据，构建品种间的UPGMA系统聚类图。结果显示12个座位均可作为有效遗传标记用于各群体的遗传参数检测。9个品种中，平均He的范围为0.5414-0.6315 , PIC也反映了相近的结果;Fis为0.12650.3381, DA遗传距离为0.101-0.279。UPGMA法聚类分析显示:金定鸭与山麻鸭、高邮鸭与吉安红毛鸭先聚类，后与广西小麻鸭聚为一类;荆江麻鸭与靖西麻鸭聚为一类，枚县麻鸭与临武鸭聚为一类。