生态监测是利用各种技术测定和分析生命系统各层次对自然或人为作用的反应或反馈效应的综合表征来判断和评价这些干扰对环境产生的影响、危害及其变化规律，为环境质量的评估、调控和环境管理提供科学依据。生态监测指标体系主要指一系列能敏感清晰地反映生态系统基本特征及生态环境变化趋势的并相互印证的项目。生态监测最核心的基本原理是“准确性原理”，即监测活动及其所获得的环境信息是环境历史和环境管理的记录，是环境历史的“镜像”反映，同时体现环境和环境管理的真实性及环境信息的权威性。重点分析了微生物检测，无脊椎动物检测，有脊椎动物的毒理性验证。未来生态环境监测的总体趋势是：3S技术和地面监测相结合，从宏观和微观角度来全面审视质量；网络设计趋于一体化，考虑全球生态质量变化，在生态质量评价上逐步从生态质量现状评价转为生态风险评价，以提供早起预警；在信息管理上强调标准化、规范化，广泛采用地理信息系统，加强国与国之间的合作。目前美国、欧洲、日本和我国都在制定新大的观测计划，这些计划的实施将为区域环境监测提供重要的数据。充分利用计算机技术把遥感、航照、卫星监测、地面定点监控有机结合起来，依靠专门的软硬件使生态监测智能化，使生态资料数据网络化，是目前以及今后相当长的一段时间里监测人员的重点工作内容。