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基因组测序与合成技术的快速发展，显著提高了微生物基因组改造能力，为发展基因组工程奠定了技术基础。计算机辅助分析改变了我们对生化反应和代谢路径的固有认识，拓宽了微生物基因组工程改造的思路。快速发展的基因组编辑技术，彻底颠覆了以"一次操作、一个抗性基因、一个修饰位点"为特征的传统遗传操作模式，实现了对基因组序列进行多位点的同步编辑、高效的插入替换或删除和大片段的剪切-粘贴等。这些微生物基因组尺度的系统工程策略与高效的基因组编辑技术，预期将在未来几年得到广泛应用，并助推工业生物技术跃迁到一个崭新阶段。