变应性鼻炎小鼠CD4+T细胞lncRNA芯片表达谱分析

来源 :2017上海市医学会变态反应学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liunian2008
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  背景:变应性鼻炎以Th2 反应为主的过敏性疾病.最近的研究表明长链非编码RNA(lncRNAs)参与免疫反应和各类免疫细胞如树突细胞、B 淋巴细胞和T 淋巴细胞的分化激活过程.然而,lncRNA 在变应性鼻炎中的作用尚无相关报道.目的:本研究旨在初步探索小鼠脾脏CD4+T 细胞中的lncRNAs 对变应性鼻炎的影响.方法:选取变应性鼻炎小鼠脾脏CD4+T 细胞为实验组,正常小鼠脾脏CD4+T 细胞为对照组,采用lncRNA 表达谱芯片检测两组之间lncRNA 和mRNA 的表达差异并利用qRT-PCR 技术验证芯片可信度.利用生物信息学分析变应性鼻炎中包含的相关信号通路,建立lncRNA 与mRNA 的共表达网络,筛选与通路相关的lncRNA.结果:两组之间存在158 种差异lncRNA,其中上调lncRNA110 种,下调lncRNA48 种.GO 与KEGG 通路分析显示化学信号传导通路和钙离子信号通路在变应性鼻炎T 细胞分化发育过程中起重要作用.最后,共表达网络分析显示8 种差异lncRNA 与T 细胞分化高度相关.结论:本研究首次证实变应性鼻炎小鼠CD4+T 细胞中存在大量差异表达的lncRNA,以lncRNA这一新视角为切入点,为变应性鼻炎的治疗提供新的方向.
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