单分子拉伸力作用下DNA解链动力学无序的涨落瓶颈模型研究

来源 :中国化学会第29届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:emydisk
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  单分子拉伸力实验对DNA解链动力学的研究发现了剪断力分布的宽尾特征,意味着解链动力学速率的含时涨落,即动力学无序现象。基于Zwanzig涨落瓶颈模型(fluctuating bottleneck model),假设解链过程的速率与DNA构型开—合态密切相关,正比与沿反应通道的瓶颈面积。采用一维广义朗之万方程描述瓶颈半径的随机涨落,受到与构型慢涨落密切相关的分数高斯噪声的影响。采用随机泛函分析方法,求解得到恒速拉伸力作用下的剪断力分布。拟合不同恒速拉伸力实验数据,确定本征动力学参数。结果发现,涨落瓶颈模型能很好地解释单分子拉伸力作用下DNA解链动力学的剪断力分布的宽尾特征,揭示了该动力学无序效应与DNA构型涨落亚扩散机制的内在关联。
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