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目的：检测儿童肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,SP)耐药情况和耐红霉素的耐药基因分析。方法：(1)收集重庆医科大学附属儿童医院2002年至2008年门诊及住院部就诊的呼吸科、血液科、心脏内科、传染科、新生儿科、内分泌科等患者的3642株临床分离株，应用纸片扩散法(K-B法)对患者痰液、血液、脓液、咽拭子、分泌物、脑脊液、眼分泌物或其它标本中的SP进行耐药性检测，药物包括：药敏有青霉素(苯唑青霉素OX)、红霉素(E)、复方新诺明(SXT)、氯霉素(C)万古霉素(VA)、氧氟沙星(OFX)、四环素(TE)、利复平(RD)(2)采用PCR扩增70株耐药SP基因组DNA，琼脂糖电泳分析SP大环内酯类抗生素耐药基因：核糖体甲基化酶基囚(ermB)、主动外排转运基因(mefA)2种基因表达。结果：重庆地区小儿SP临床分离株对青霉素类、大环内酯类、四环素和复方磺胺抗生素耐药率高>70%；对红霉素的耐药率最高93.9%；70株耐红霉素SP分离株中，有44株同时携带ermB和mefA两种基因，占62.86%；有6株仪携带ermB基因；有19株仅携带mefA基因；仅有1株未发现携带有ermB或mefA基因。结论：重庆地区小儿SP临床分离株呈多重耐药趋势，通过对大环内酯类抗生素耐药基因检测得出重庆地区SP临床分离株主要的耐药机制是：erm基因介导的靶修饰作用和mef基因介导的外流排出机制共同作用的结果。