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绿石沟岩体位于东准噶尔琼河坝地区的绿石沟铜矿西侧，向东侵入到绿石沟铜矿富矿围岩中泥盆统北塔山组火山岩中。LA-ICP-MS锆石U-Pb测年显示该岩体形成于354±1Ma，表明绿石沟铜矿形成时代应为中-晚泥盆世。岩体主要岩石类型石英二长岩，含有大量的基性岩包体，具有较高的硅、钙、钾含量(SiO2=62.31％～65.31％,CaO=3.71％～4.89％,K2O=2.85％～3.54％),属高钾钙碱性系列，富铝(Al2O3=15.44％～16.29％)，属准铝质，显示出高Ba-Sr花岗岩的特征，显示该岩体应是幔源基性岩浆与地壳岩浆混合的产物表明东准噶尔地区除晚古生代与造山后有关的岩浆活动强烈外，在早-中古生代也是一个高峰期，与俯冲关系密切。在早石炭世(340M～350Ma)似乎出现一个岩浆宁静期，与阿尔泰地区古生代的岩浆活动具有相似性，暗示构造演化具有相似性，即早-中古生代俯冲、晚古生代中晚期转入后造山后伸展背景，早石炭世是一个构造转换期，形成于354Ma绿石沟岩体可能形成于俯冲环境与造山后环境的构造转换期，可能形成于俯冲环境和造山后环境的构造转换阶段。