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樱桃谷肉鸭具有高蛋白、低脂、低胆固醇、肉质好、免疫性强，生长期间基本不用药物等特点，是世界公认的品质最好的肉鸭品种，为了了解樱桃谷鸭的遗传结构及其其它鸭品种的亲缘关系，从由美国购进樱桃谷鸭种群中随机选取了56个样本，对其线粒体的Cytb进行测序，结合分子系统学方法56个体组成樱桃谷鸭群体内的线粒体DNA多态性以及遗传距离进行了分析。为今后评价群体的遗传纯度、鉴定群体间亲缘关系进而为下一步制定育种策略提供有力的理论依据和科学方法，对鸭品种的起源演化以及合理的开发利用都具有重要的指导意义。