为了解上海地区不同动物隐孢子虫感染情况及感染虫种,建立小鼠、兔隐孢子虫实验动物模型。从上每市不同区县采集宠物犬、鸽子、黄牛、山羊、鹌鹑、梅花鹿、黑天鹅及实验动物新西兰白兔、东方田鼠、昆明系小鼠、大鼠粪便,采用Sheather’s蔗糖飘浮法和改良抗酸染色法进行检查。利用PCR-RFLP对部分动物粪便中分离的隐孢子虫核糖体小亚基(SSU)RNA基因进行扩增,对扩增产物进行序列测定和系统发育进化分析。结果发现,鸽子、黑天鹅、大鼠粪便中未发现隐孢子虫;其它被调查动物均发现存在隐孢子虫感染,其中宠物犬、山羊、鹌鹑、梅花鹿、兔子、东方田鼠、实验小鼠的阳性率分别为1.5%、26.3%、63.3%、36.6%、8.5%、54.5%、2.9%;此外,检查的1头黄牛也为阳性。对小鼠、兔子、山羊、鹌鹑源隐孢子虫进行分子鉴定和序列进化树分析,发现上海地区实验小鼠感染的是隐孢子虫鼠基因型(Cryptosporidium mouse genotype);兔源隐孢子虫虫种为隐孢子虫兔基因型(Cryptosporidium rabbit genotype);山羊感染的是隐孢子虫鹿基因型(Cryptosporidium cervine genotype);鹌鹑感染的是火鸡隐孢子虫(Cryptosporidium meleagridis)。鼠、兔源隐孢子虫成功感染本种动物,昆明系小鼠接种鼠源隐孢子虫后,最短潜伏期为3d,最长转阴时间为8周;新西兰白兔感染兔源隐孢子虫后15d左右就不再排卵囊。