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在高度城市化的干旱及半干旱地区,污水处理厂出水已成为城市河流的重要补给水源.然而污水处理厂出水对河流生态系统的影响,特别是对河流微生物群落的影响研究较为缺乏.本研究对北京市五座大型污水厂出水及受纳河流进行采样.16S rRNA基因高通量测序及相关分析表明,不同处理工艺的五座污水厂出水微生物群落组成具有相似性,但对受纳河流微生物群落的影响存在差异.β-变形菌纲(Betaproteobacteria)为出水及受纳河流的最优势菌群(20%-55%).出水及受纳河流样品中均存在参与微污染物(如双酚A、多环芳烃)代谢途径的微生物.环境因子-物种组成关系表明,温度、pH、溶解氧和氨氮为构成微生物群落组成差异的关键环境因子.