论文部分内容阅读
目的:采用RNA-seq测序技术检测斑蝥素酸镁对肝癌HepG2细胞转录组的影响,为后续深入阐明斑蝥素酸镁抗癌机制以及新靶点的发现做前期准备工作。方法:利用RNA-seq测序技术检测斑蝥素酸镁作用于肝癌HepG2细胞后转录组水平的变化情况。根据[log1FC]>1、同时probability>0.8为阈值,过滤差异表达基因。再结合文献调研的方法对差异基因(或非编码RNA)进行分析。结果:共发现199个显著差异表达的基因(包括蛋白编码基因、非编码RNA、假基因和一些其他未知功能的RNA),其中有117个显著上调,而81个显著下调。通过文献调研,发现了其中与肿瘤密切相关的3个差异基因((PIGR、CYP2B6、ADGB))和3个长链非编码RNA((HULC、TUG1和HOAll-AS)(表1)。讨论:斑蝥素酸镁是课题组在传统中药斑蝥中挖掘出来的具有自主知识产权的新化合物,但其抗肝癌作用靶点和分子机制尚不明确。本研究采用RNA-seq测序技术对斑蝥素酸镁作用于肝癌细胞HepG2后的转录组变化情况进行检测,发现了3个蛋白编码基因(PIGR,CYP2B6、ADGB)和3个长链非编码RNA(HULC、TUG1和HOA11-AS)可能与斑蝥素酸镁抗肝癌的活性有关。相关文献表明PIGR,CYP266基因表达降低和ADGB基因表达升高往往与肿瘤的发生有一定的相关性。另外,越来越多的研究表明lncRNA在肿瘤的发生发展过程当中也扮演着重要的角色。本实验筛选出来的3个长链非编码RNA((HULC、TUG1和HOA11-AS),其中HULC以在肝癌中过度表达而得名;而HOXA11-AS也被证实可作为区分结肠癌细胞与正常细胞标志的biomark。所以斑蝥素酸镁可能通过增加PIGR、CYP266和降低ADGB的基因表达以及下调lncRNAHULC、lncRNATUG1和上调lncRNAHOA11-AS的表达水平来实现对肝癌细胞的抑制增殖活性。本研究为后续深入阐明斑蝥素酸镁抗癌机制以及新靶点的发现提供了一些有益的线索。