【摘 要】
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本研究设计合成了针对VP1和3A基因特异性引物,利用RT-PCR方法扩增获得6个口蹄疫病毒分离株完整VP1和3A基因,测序结果分析表明,6个分离株的VP1基因全长639bp,编码213个氨基酸,
【机 构】
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南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏,南京,210095
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第六届理事会第二次会议暨教学专业委员会暨第六届代表大会
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本研究设计合成了针对VP1和3A基因特异性引物,利用RT-PCR方法扩增获得6个口蹄疫病毒分离株完整VP1和3A基因,测序结果分析表明,6个分离株的VP1基因全长639bp,编码213个氨基酸,与国内外发表的O型毒株VP1基因核苷酸序列同源性为73.6％～98％,所推导的氨基酸序列同源性为79.8％～98.1％;3A基因核苷酸同源性为67.5％～97.4％,推导的氨基酸序列同源性为66.7％～95.4％.5个分离毒(O/ShH02/01、O/ShH02/02、O/ShH02/03、O/ShH02/04、O/SD03/01)的VP1和3A基因都与O/SKR/2002和O/UKG/35/2001同源性最高,属于ME-SA拓扑型中的PanAsia(泛亚株);而O/AH03/01的VP1和3A基因则与O/HKN/2002和O/Taiwan/97的同源性最高,属于O型口蹄疫病毒的Cathay拓扑型,并且与O/HKN/2002和O/Taiwan/97相同3A基因在93～102位均存在缺失现象.对此6株分离病毒的VP1基因序列测定和分析,丰富了我国FMDV毒株VP1基因资料库,3A基因测序和分析,则为我国FMDV流行趋势及宿主异嗜性变化方向提供理论依据.
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