目的：调查川芎内生真菌对川芎油的影响情况。 方法：采用组织块法分离、形态鉴定内生菌种群。溶剂法提取川芎油，GC-MS分析挥发性组分。采用稳健回归分析内生真菌和川芎油的相关性。 结果：从4个产地的川芎根茎分离获到内生真菌有11属，47株;在属的水平上，头孢霉属、拟小卵孢属、曲霉属为优势种群，四川产区和甘肃产区的内生真菌差别较大，四川产区的优势种群为头孢霉属、拟小卵孢属，甘肃为曲霉属。川芎油的含量与头孢霉属、拟小卵孢属、隔指孢属呈正相关，藁本内酯的含量与头孢霉属、拟小卵孢属、隔指孢属呈正相关，2-chloro-5，5-dimethyl-1-phenyl-3-hexen-1-ol与青霉属、沃德霉属、轮枝孢属、隔指孢属、链格孢属呈正相关，0-羟基苯乙烯与头孢霉属、沃德霉属、镰孢属呈正相关，4-Dichlorolilethy1-4-methyl-2，5-cyclohexadien-1-one与青霉属、轮枝孢属、链格孢属呈正相关。 结论：四川川芎内生真菌的种群结构相对稳定，川芎油及其组分与内生真菌具有一定的相关性，是川芎生产中具有重要应用前景的生物资源。