车前叶蓝蓟毛状根的诱导以及转录组分析

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紫草素类化合物(alkannin/shikonin and their derivatives)是存在于紫草族(Trib.Lithospermeae)植物根部的一类天然活性物质。其不仅是一种著名的天然红色色素,还是一种重要的药用天然产物,具有抗菌、消炎、促进伤口愈合等作用。目前,国内外对于紫草素类化合物的研究主要集中于硬紫草,新疆软紫草,滇紫草等紫草科(Boraginaceae)植物。车前叶蓝蓟(Echiunmplantagineum)属紫草科蓝蓟属(Echium)的草本灌木,具有易种植,繁殖快,环境适应性强等优点。因此,本研究诱导了车前叶蓝蓟的毛状根诱导体系;其次,还利用转录组分析发现了一些车前叶蓝蓟中与紫草素合成正相关的基因。具体结果如下:1.使用发根农杆菌ATCC15834成功诱导了车前叶蓝蓟毛状根体系。2.本研究利用RNA-seq技术对车前叶蓝蓟不同时间点的幼根及幼叶、成熟主根不同部分的样品进行了转录组测序与分析,de novo组装获得121004个Unigenes基因,N50长度达2.1kb。对de novo组装结果进行基因本体和通路分析以及各样品间的Unigenes表达量分析,共获得1088个Unigenes基因可能与紫草素生物合成正相关的候选基因。3.筛选得到12OPR-CL430.3基因拷贝,并对ORF区(开放阅读框)进行全长扩增,获得了它们的全长CDS序列。本研究为车前叶蓝蓟中紫草素合成分子代谢的研究奠定了一定基础,并且为代谢工程规模化生产紫草素类化合物以及相关转基因研究提供了一定的基础。
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