建兰基因内部SSR标记的初步开发

来源 :中国园艺学会观赏园艺专业委员会2014年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hongyanzhiji761112
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  建兰是兰属植物中的一种,香气袭人,具有很高的观赏价值.目前,其分子标记数量有限.为了开发可靠、有效的分子标记,本研究对建兰转录组数据进行SSR搜索,根据基元、长度和所在位置选取30个SSR进行引物设计.在10个建兰品种中尝试性地扩增,结果发现22个引物成功扩增,其中12个引物有多态性,其PIC范围为0.160~0.770,平均为0.371.然后对能成功扩增的30个SSR所在基因序列进行基因注释,发现29个比对上了数据库的序列.这12个多态性标记可用于建兰的遗传多样性、图谱构建和基因定位等研究,相应的基因注释信息丰富了这些标记的内涵.
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