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植物DNA条形码(DNA barcoding)研究是近10年来进展最迅速的学科前沿之一，该技术已促进传统药用植物鉴定领域发生重大变革，随着该技术的发展，复合序列的使用方式已成为业内广泛关注的热点问题。2006年Newmaster等提出“分级鉴定”模式的复合序列使用构想，但该构想一直未有具体序列工作流程证实其效果。
本研究采用国际通用的条形码rbcL、matK和psbA-trnH序列对百合科药用植物42属266种489样本进行鉴定研究。并对比“分级鉴定法”与“联合序列法”优劣。单一序列结果显示rbcL序列PCR成功率最高；psbA-trnH序列种间遗传距离明显大于种内，同时其物种水平鉴定成功率最高。复合序列使用方法考察结果说明，基于3条序列的“分级鉴定法”较“联合序列法”鉴定范围扩大了17倍，其物种水平鉴定成功样本数目扩大了14倍。本研究结果表明以rbcL序列为第一级鉴定序列，psbA-trnH、matK序列为第二级鉴定序列的分级DNA条形码鉴定模式非常适合百合科药用植物鉴定研究。
本研究采用国际通用的条形码rbcL、matK和psbA-trnH序列对百合科药用植物42属266种489样本进行鉴定研究。并对比“分级鉴定法”与“联合序列法”优劣。单一序列结果显示rbcL序列PCR成功率最高；psbA-trnH序列种间遗传距离明显大于种内，同时其物种水平鉴定成功率最高。复合序列使用方法考察结果说明，基于3条序列的“分级鉴定法”较“联合序列法”鉴定范围扩大了17倍，其物种水平鉴定成功样本数目扩大了14倍。本研究结果表明以rbcL序列为第一级鉴定序列，psbA-trnH、matK序列为第二级鉴定序列的分级DNA条形码鉴定模式非常适合百合科药用植物鉴定研究。