在Luminal B乳腺癌细胞中,通过SAPAS测序分析构建选择性多肽腺苷酸化位点谱图

来源 :山东省抗癌协会第五次会员代表大会暨山东省第四届肿瘤学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shaofenglanzi
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  目前因癌症死亡的妇女当中,乳腺癌是重要的致死因素,并且乳腺癌是一种分子异质性的疾病。以前的研究表明,可变的mRNA加工,特别是选择性多聚腺苷酸化[alternative polyadenylation (APA)],是重要的预后好坏的生物标记。为了评估可变多聚腺苷酸化位点转换[switching events]与乳腺癌分子亚型的相关性,我们通过对选择性的多态性位点进行测序[sequencing alternative polyA sites(SAPAS)]的方法来构建乳腺癌Luminal B亚型的选择性多聚腺苷酸化位点的谱图。我们发现,与MCF-7细胞系相比,Luminal B亚型的APA位点switching并不是非常普遍。与恶性肿瘤样本相比较,低增殖的原发肿瘤样本中,有更多的参与switching的基因的3UTR变短。目前许多研究发现并证实许多潜在的生物标记物的串联3 UTR长度不同,标记物的表达水平也显著不同。目前只是部分证实相关的生物学过程以及涉及的通路。总体来讲,从APA位点的分析方面来看,我们的工作可能会为乳腺癌诊断以及预后提供新的视点。
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