内生真菌紫杉醇合成期与非合成期基因表达差异的分析

来源 :纪念中国微生物学会成立六十周年大会暨2012年中国微生物学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yigeyongbao
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  采用mRNA差异显示技术比较了紫杉醇产生菌HDF-68在不同发酵培养时期基因的表达差异,并对菌株HDF-68紫杉醇合成期出现的特异表达和增强表达的条带进行了回收和克隆,获得了38个差异表达的条带。经反向Northern杂交验证,22个片段为假阳性片段,16个片段的杂交信号及其强度和DDRT-PCR中获得的结果一致。EST片段的ORF分析结果表明,在全部的16条EST中,都找到了一个或一个以上的ORF,说明所获得的EST片段都处于基因的编码区。另外,16条EST中,有7条EST编码产物在蛋白质数据库中找到了同源蛋白,但是只有2个片段编码产物的同源蛋白为己知蛋白,其他均为假想蛋白。
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对Cytophaga hutchinsonii基因组的生物信息学分析显示,在C.hutchinsonii中并没有持续性的纤维素酶,但经研究发现,CHU―2103是一个多功能酶,具纤维素内切酶、外切酶以及糖基转移酶的活性。且金属离子对其活性也有一定的影响。因此,纤维素内切酶可能是C.hutchinsonii高效降解纤维素酶系统的一个重要组成部分,或许会对揭示C.hutchinsonii的纤维素降解机