Conformational control in structure-based drug design with case studies

来源 :2019中国化学会第十五届全国计算(机)化学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qweasdzxc34
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Poly-ADP-ribose polymerase 1(PARP-1)is the highest content isoform of PARPs and the inhibition of PARP-1 is considered a promising anticancer strategy.
木质素是木质纤维素原料的三大组成成分之一,是自然界中唯一能提供可再生芳基化合物的资源,其应用前景非常广阔。利用反应分子动力学模拟的方法研究木质素热解的反应机理对木质素的高效利用具有重要意义,而木质素的模型构建是其中的关键一步。
药物开发是一个复杂,耗时耗力且昂贵的过程,主要包括靶点确证、分析开发、筛选以及发现先导化合物等步骤。在药物发现过程的各种技术中,基于已知配体结构或受体结构的虚拟筛选成为一种常用的方法。
GPR91 受体与非酒精性脂肪性肝炎的肝纤维化过程密切相关,是一个潜在的药物治疗靶点。本研究旨在通过计算机辅助药物设计手段研究GPR91 受体与其激动剂琥珀酸和抑制剂7e 之间的结合模式,阐明其中关键的氨基酸残基,并探究受体激活的相关机制,为进一步的抗非酒精性脂肪性肝炎药物研发提供理论依据。
卤键是一种被广泛应用于多个领域的非共价相互作用。根据IUPAC的定义1,卤键是指含卤分子实体中,卤原子的亲电区域,与同一或另一分子实体中亲核区域的净吸引作用。
体内实验(in vivo)和体外实验(in vitro)是药物作用,生命过程,和毒理分析等研究的两大主要手段。近年来,毒理基因组学作为一个强大的毒理学研究工具,也产生了大量体内和体外实验相关数据。
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机器学习算法是重要的数据挖掘的方法,可用于预测抑制剂的生物活性,并对化合物库进行虚拟筛选,找到潜在的活性化合物; 机器学习算法还可用于抑制剂骨架结构的分类研究,用于研究高活性化合物的结构特征。
由多种原因引起的肾病综合征(NS),是以肾小球基膜通透性增加伴随肾小球滤过率降低为主的常见的临床综合征,其常规治疗方法为免疫抑制剂与糖皮质激素联合使用,可治疗多种不同病理类型的肾病综合征。
The discovery and development of a new drug is a long journey,with lots of challenges.On the other hand,recently AI technologies have made tremendous progress and have been applied to various industri