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提出了一种基于灰度投影梯度的cDNA基因芯片图像自动划格算法，首先，对基因芯片图像进行自动分块，然后，对分块后的每一子图像块实行基于灰度投影梯度算法的自动划格。采用美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库上GSE1073数据集中的60幅酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)cDNA基因芯片图像进行划格实验，验证了该算法的有效性。