【摘 要】
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对香菇单核体菌株Wl-26进行了基因组测序和De novo组装,获得了大小为39-Mb的基因组序列.香菇基因组中的重复序列以LTR为主,其总含量达到基因组序列长度的9.88％.12,936个基因模
【机 构】
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华中农业大学应用真菌研究所 湖北 武汉 430070
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对香菇单核体菌株Wl-26进行了基因组测序和De novo组装,获得了大小为39-Mb的基因组序列.香菇基因组中的重复序列以LTR为主,其总含量达到基因组序列长度的9.88％.12,936个基因模型得到了预测,其中94.6％的基因包含内含子,平均每个基因长2,069bp,含有6.72个CDS区.83.5％的基因能比对到Nr数据库,49.88％的基因有GO注释结果.对香菇和其它13个真菌进行同源基因聚类,结果表明香菇中的同源基因分成了7,212个类,7929(61.29％)个基因在其它物种中存在orthologs.根据524个单拷贝同源基因所得的系统发育树准确的验证了多个真菌物种之间的亲缘关系以及香菇的分类地位.此外,通过比较这14种真菌的碳水化合物活性酶家族,表明了香菇中具有降解多糖功能的基因数目高于其它大型真菌,分解木质素的AA1和AA2家族的基因总数高于其它真菌,揭示了香菇作为一种白腐真菌,具有着极强的降解木质纤维素的潜在能力.
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