【摘 要】
:
目的:研究广西北仑河口红树林根际土壤放线菌的多样性,为新放线菌资源及新抗生素的发现奠定基础.方法:采用5种分离培养基,稀释涂布法分离放线菌;PCR扩增,16S rRNA基因序列比对,分析放线菌多样性;菌株经液体发酵,上清液经乙酸乙酯萃取,菌丝经丙酮浸泡,分别获得水层样品、酯相样品和丙酮浸提液三类样品;样品通过纸片扩散法进行抗菌活性初筛;探测抗菌阳性菌株PKS Ⅰ、PKS Ⅱ及NRPS抗生素生物合成
【机 构】
:
桂林医学院基础医学院,广西桂林541004;北京协和医学院&中国医学科学院医药生物技术研究所,北京100050
【出 处】
:
第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会
论文部分内容阅读
目的:研究广西北仑河口红树林根际土壤放线菌的多样性,为新放线菌资源及新抗生素的发现奠定基础.方法:采用5种分离培养基,稀释涂布法分离放线菌;PCR扩增,16S rRNA基因序列比对,分析放线菌多样性;菌株经液体发酵,上清液经乙酸乙酯萃取,菌丝经丙酮浸泡,分别获得水层样品、酯相样品和丙酮浸提液三类样品;样品通过纸片扩散法进行抗菌活性初筛;探测抗菌阳性菌株PKS Ⅰ、PKS Ⅱ及NRPS抗生素生物合成基因.结果:从7份红树林植物根部土壤样品中分离纯化得到107株放线菌,分布于放线菌纲的7个目8个科15个属,优势菌属为小单孢菌属和链霉菌属;比对菌株N04M112、3804M13、Z05M23、Z07M34的16S rRNA基因序列发现其与有效发表菌株Agromyces humatus CD5T(AY618216)、Streptomycesatroviren NRRLB-16357T(DQ026672) 、 Streptosporangium jomthongense 30EHST(JQ922513) 、Micromonospora wenchangensis 2602GPT1-05TJQ768361的相似率最高为97.49%、98.42%、98.58%、98.54%,可能为潜在新物种.51株放线菌的抗菌活性筛选,发现抑菌圈直径在7mm以上的阳性菌株为33株,阳性率为64.71%.对46株放线菌功能基因探测发现42株菌至少有一种功能基因,总阳性率91.30%,三种生物合成基因簇均为阳性的为10株.结论:广西北仑河口红树林根际土壤中含有较为丰富的放线菌资源,具有从中发现新放线菌物种、新抗生素的潜力.
其他文献
气象服务与农业生产之间有着千丝万缕的联系,对农业发展和灾害防御起着非常重要的作用,因此,要不断完善农业气象服务系统,加强气象服务与农业服务的有机结合。本文阐述了气象服务的概念、现状和存在的问题,并提出了提高气象服务水平的对策和建议。
回顾近100年来科学发展,相对论和量子论的发表,是深刻改变科学进程的重大事件。同样在100年前,噬菌体被首次发现。这是生态意识下的发现,随后被视为模型生物,建立抗细菌感染措施、追问遗传物质本质,揭示遗传密码三联体、转导现象、mRNA,发展工具酶等,成就了近代分子生物学。如今我们知道无处不在的噬菌体是生物圈中数量最大的生命体,达到1030-1032,作为生态模型体系,她,平衡初级生产力,提供抗生素耐
利用厌氧微生物菌系将残留在地下油藏中无法开采的原油转化甲烷进行气体开采,是近年来国内外关注的微生物采油新技术之一.而分离鉴定“油藏变气藏”过程中发挥作用的微生物, 研究其群落结构以及其代谢机理有助于进一步发展微生物采油技术,为解决世界能源问题提供新方案.本课题组经过多年的驯化培养,获得一个稳定的高温(55℃)正十六烷烃降解产甲烷菌系SK,并利用Hungate滚管法从SK菌系中分离获得了菌株SK-Y
In the present study,we have made an identification and genotyping analysis for the microbial strains isolated from Tibetan kefir grain to the strain level via a combination of genesequencing and (GTG
本文主要对从沙冬青根际分离得到的48株解磷菌和60株固氮菌进行产铁载体的能力分析.通过CAS检测平板筛选出能够产铁载体的细菌,通过改良的MAS(蔗糖-天冬氨酸)液体培养基培养产铁载体细菌,并且通过分光光度计法测定铁载体活性.48株沙冬青根际解磷菌和60株固氮菌在定性检测平板上有铁载体晕圈出现,另有10株解磷菌和9株固氮菌不出现,并且根据铁载体晕圈的大小筛选出13株产铁载体能力较强的细菌.定量测定结
纤维素是地球上最丰富的可再生资源,它是解决石化能源短缺及其引起的环境污染问题的最具潜力的途径.现有纤维素酶活性不够高,是现阶段纤维素无法代替石化能源的关键性限制因素,而对于气温较低的地区,低温是纤维素利用的另一主要限制因素.研究筛选低温高酶活纤维素酶是解决问题的关键.内蒙古属于温带地区,年均气温较低,低温季节持续时间较长.因此,结合地区特点,对内蒙古不同地区土壤中低温(10℃)降解微生物进行分离和
聚羟基脂肪酸酯(PHA)与聚烯烃的理化性质相似但具有良好的生物可降解性和生物兼容性,因此是塑料产品的理想替代品。近来,利用混合菌群将丙酸废水转化成PHA受到了广泛关注,但在产PHA菌群富集阶段,关于微生物群落如何响应丙酸废水发生改变还不清楚。本研究以污水处理厂污泥为出发接种物,在营养/饥饿(Feast/Famine)模式下利用丙酸废水富集了产PHA的微生物菌群,采用批式发酵方式对该富集物在不同底物
水稻是我国的主要粮食作物。机械化已成为水稻生产发展的重要方向,而育秧难特别是育秧基质问题是制约机插稻发展的一个重要因素。为合理开发利用秸秆有机基质,解决因废弃或焚烧带来的资源浪费和环境污染问题。课题组筛选出能够快速分解秸秆的微生物,并研制成了复合腐秆菌剂,前期研究表明该菌剂可显著提高稻草堆肥质量及稻草还田效果。本文以水稻土为对照,以接种和不接种腐秆菌剂的稻草制成的腐熟稻草粉与水稻土混配均匀得到的育
以湘鄂渝黔四省市交界的武陵山区特殊生态环境中的微生物资源为研究对象,用微生物生态学、分子生物学及多相分类方法,开展微生物多样性、种质保护和生态适应机制等基础研究,并开展这些特色微生物资源在医药、农林和环保领域的资源化利用等应用基础研究,建立相应微生物种质资源保藏库和管理系统.目前主要开展课如下工作:(1)非盐环境中嗜盐和极端耐盐菌多样性、分类学及种质保护:在国家基金项目“硇洲岛潮汐带无脊椎动物相关
热劈气相色谱在微生物分类鉴定中有快速、经济、有效等优势,但迄今在热劈温度的选定上尚无确定标准。本研究通过在不同热劈温度相同色谱条件下对各类微生物(细菌、真菌、古菌)分析发现同一菌种在不同温度下有不同裂解特征(图1,Ⅰ和Ⅱ),同一菌种在不同温度下特征峰差异明显;不同的菌种在相同的温度下可能具有类似的裂解特征(图1,Ⅲ和Ⅳ中的A、B和C三种菌在500℃和800℃相似性均很高,但真菌(D)与ABC三种菌