【摘 要】
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目的：研究广西北仑河口红树林根际土壤放线菌的多样性,为新放线菌资源及新抗生素的发现奠定基础.方法：采用5种分离培养基,稀释涂布法分离放线菌；PCR扩增,16S rRNA基因序列比对,分析放线菌多样性；菌株经液体发酵,上清液经乙酸乙酯萃取,菌丝经丙酮浸泡,分别获得水层样品、酯相样品和丙酮浸提液三类样品；样品通过纸片扩散法进行抗菌活性初筛；探测抗菌阳性菌株PKS Ⅰ、PKS Ⅱ及NRPS抗生素生物合成
【机 构】
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桂林医学院基础医学院,广西桂林541004;北京协和医学院&中国医学科学院医药生物技术研究所,北京100050
【出 处】
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第八届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会
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目的：研究广西北仑河口红树林根际土壤放线菌的多样性,为新放线菌资源及新抗生素的发现奠定基础.方法：采用5种分离培养基,稀释涂布法分离放线菌；PCR扩增,16S rRNA基因序列比对,分析放线菌多样性；菌株经液体发酵,上清液经乙酸乙酯萃取,菌丝经丙酮浸泡,分别获得水层样品、酯相样品和丙酮浸提液三类样品；样品通过纸片扩散法进行抗菌活性初筛；探测抗菌阳性菌株PKS Ⅰ、PKS Ⅱ及NRPS抗生素生物合成基因.结果：从7份红树林植物根部土壤样品中分离纯化得到107株放线菌,分布于放线菌纲的7个目8个科15个属,优势菌属为小单孢菌属和链霉菌属；比对菌株N04M112、3804M13、Z05M23、Z07M34的16S rRNA基因序列发现其与有效发表菌株Agromyces humatus CD5T(AY618216)、Streptomycesatroviren NRRLB-16357T(DQ026672) 、 Streptosporangium jomthongense 30EHST(JQ922513) 、Micromonospora wenchangensis 2602GPT1-05TJQ768361的相似率最高为97.49％、98.42％、98.58％、98.54％,可能为潜在新物种.51株放线菌的抗菌活性筛选,发现抑菌圈直径在7mm以上的阳性菌株为33株,阳性率为64.71％.对46株放线菌功能基因探测发现42株菌至少有一种功能基因,总阳性率91.30％,三种生物合成基因簇均为阳性的为10株.结论：广西北仑河口红树林根际土壤中含有较为丰富的放线菌资源,具有从中发现新放线菌物种、新抗生素的潜力.
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