本试验利用毛细管电泳技术对香蕉品种资源进行AFLP分子标记研究，在前期研究的基础上，选取两对引物EcoR ACC+Mse CAT和EcoR ACC+Mse CAG对供试材料进行了基因组水平上的多态性检测，获得了比较清晰的毛细管电泳图谱，供试的73份香蕉种质显示山丰富的多态性，共得到扩增位点245个，其中多态性位点199个，多态性位点比例达到810.2％，对73份材料的区分率达到100％。根据毛细管电泳图谱聚类分析，在相似系数00.76的水平上，将可73份香种质划分为6个类群，传统的Simmonds分类系统中的各人类型基本能聚类在一起，但其中部分品种的分类地位与Simmonds分类系统存在差异，研究结果显示粉蕉与大蕉两个类群之问遗传距离差异明显，将其简单的归为ABB类型不能反映品种间的亲缘关系。同时，对一些特殊种质进行了鉴定，结果表明几内亚和苹果两份种质材料实际上为同一个品种。