分子模拟预测离子液体修饰Porcine Pancreas脂肪酶修饰位点研究

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离子液体作为一种新型化学修饰剂已成功地应用于酶的修饰改造,修饰酶的活性、耐有机溶剂性、对映体选择性等催化性能及热稳定性都得到了不同程度的提高,但目前的研究没能对修饰机理作出合理的解析[1-3]。本研究运用分子动力学手段,以Porcine Pancreas脂肪酶(PPL)为研究模型,分析了两种不同链长的咪唑类离子液体[HOOCBMIm][Cl]和[HOOCMMIm][Cl]对PPL修适度和修饰位点的影响,对修饰的具体位点进行了预测,预期进一步阐述离子液体修饰酶催化性能变化的分子机制。通过分析溶剂可及面积、键占据(氢键及离子键)等影响不同位点赖氨酸修饰难易程度的因素,准确预测了可修饰的Lys数目与位点。这一预测结果与我们课题组采用离子液体[HOOCBMIm][Cl]和[HOOCMMIm][Cl]修饰PPL的实验学结果一致[3]。(修饰位点预测过程示意图Fig.1)
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