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小RNA为一类非编码RNA分子，在转录水平、转录后水平和翻译水平调控植物的生长发育、生物胁迫和非生物胁迫.以番茄野生型(WT)，茉莉酸缺失突变体(spr2)为材料进行高通量测序，并通过生物信息学来分析根结线虫诱导的小RNA.通过与miRBase16.0中番茄已知miRNA比对，得到保守miRNA 29个(WT)和26个(spr2).通过与miRBase16.0中所有物种的miRNA比对，得到WT和spr2差异表达的miRNA 50个.根据miRNA前体的标志性发夹结构，预测得到新的有靶基因的miRNA 45个(WT)和52个(spr2).实验也鉴定出几十万个siRNA和其他类型的小RNA.野生型和突变体中小RNA的差异性表达说明，小RNA在参与番茄对根结线虫胁迫反应中的功能差异.GO分析表明这些miRNA靶基因参与各种生物胁迫和非生物胁迫，包括与线虫的互作反应.