为研究三峡水库藻类区系特征，于2013年对三峡水库干流和支流(香溪河、神农溪、大宁河、草堂河、梅溪河、汤溪河、磨刀溪、小江、苎溪河、童庄河、青干河、袁水河)根据不同生境特点共设置56个采样点开展逐月藻类植物标本采集和鉴定工作.结果表明：(1)全年共鉴定浮游藻类7门11纲20目34科86属.藻类主要以绿藻(Chlorophyta)、硅藻(Bacillariophyta)、蓝藻(Cyanophyta)为主，占全部种类的85％以上；(2)群落优势种主要有绿藻门的衣(Chlamydomonas)；硅藻门的小环藻(Cyclotella)、直链藻(Melosira)、针杆藻(Synedra)、星杆藻(Asterionella)；蓝藻门的微囊藻(Microcystis)、鱼腥藻(Anabaena)及假鱼腥藻(Pseudanabaena)等.(3)坝前干流水域群落组成春季以甲藻(40.2％)和硅藻(34.3％)为主，优势种为倪氏拟多甲藻及小环藻；夏季绿藻(42.4％)的衣藻及硅藻(40.4％)的小环藻为主；秋冬季以硅藻的中心纲为优势，其优势种均是小环藻，其次是直链藻、针杆藻.与水库其他水域相比，坝前物种较少，但硅藻所占的比例高于其他水域.(4)湖北库区典型支流香溪河春季以硅藻及隐藻为主，占物种比例的70％以上，优势种为小环藻及斜结隐藻.夏季以蓝藻、硅藻为主，优势种为微囊藻、鱼腥藻、小环藻等，秋季主要以隐藻、小环藻为主，冬季以小环藻为主.与整个库区相比较，隐藻全年均被检测到，优势属为斜结隐藻属.(5)重庆库区典型支流小江春夏季微囊藻、鱼腥藻的比例明显高于其他支流，平均比例高于70％；优势种为铜绿微囊藻、水华微囊藻及惠氏微囊藻、水华鱼腥藻等，秋冬季以中心纲小环藻为主.三峡水库藻类分布具有明显的季节变化和空间差异.