转录组分析揭示香菇与深绿木霉互作过程中抗性相关基因TLPs存在可变剪切现象

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木霉菌(Trichoderma spp.)是香菇(Lentinula edodes)生产过程中一类主要的竞争性真菌,是影响香菇产业经济效益的主要原因之一。采用生物胁迫模式,研究了香菇深绿木霉互作时的抗性反应。比较转录组分析表明,在受到深绿木霉菌丝胁迫作用下,香菇强抗菌株中差异表达基因有4550个,弱抗菌株中差异表达基因仅有761个。其中在强抗菌株中上调表达基因2279个,下调表达基因2269个。弱抗菌株中上调表达基因605个,下调表达基因155个。强抗和弱抗菌株中共同表达基因有424个,通过基因注释分析,筛选出与抗性相关的1个关键基因,该基因在强抗菌株中显著上调表达,而在弱抗菌株中变化不显著。该基因是一类病程相关蛋白,是植物体内普遍存在的一类防御蛋白,但目前在食用菌研究领域中未见相关报道。将该基因比对到本实验室公布的香菇参考基因组中,基因注释结果为TLPs,基因预测长度1993bp,在香菇基因组Interpro和CDD数据库查询该基因属于GH64-TLP-SF超家族,编码区长度为768bp,含有255个aa,利用SignalP4.1Server分析该基因含有一个属于分泌蛋白的信号肽,GO分类发现该基因是与抵御外界压力相关。在香菇强抗和弱抗菌株中,分别对基因TLPs进行了克隆,在强抗菌株中基因全长为1323bp,弱抗菌株中基因全长为1313bp,两个编码区序列相似度为97.01%。对香菇强抗或弱抗菌株与深绿木霉互作前后TLPs基因编码序列进行测序,发现在不同的互作模式中该基因存在可变剪切现象。
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