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葡萄是一种在全世界栽培面积大、产量高的重要果树。葡萄可以被多种病毒感染，分别诱导的不同症状，国内目前主要包括：卷叶病、皱木复合病和扇叶病。一株被4种病毒GLRaV-2，GLRav-3，GVA和GVB复合感染的“藤稔”葡萄韧皮部为材料，分别同收RT-PCR产物并克隆得到4种病毒的全长外壳蛋白基因cp。利用DNAStar软件的Clustalw方法，分别对4种病毒的在NCBI上登陆的不同地理分离株的全长cp进行多重比对分析。根据每种病毒的不同分离株的全长cp多重比对同一性值大小，16个不同地理分布GLRav-2分离株分成4个变异组；16个不同地理分布的GVA分离株分成2个变异组；7个不同地理分布的GVB分离株分成3个变异组。8个不同地理分布的GLRaV-3分离株的cp比对同一性高达990.9-920.5％，也许是一类单独、不分化的种群。进行葡萄病毒的结构蛋白基因系统进化研究，为以后利用病毒诱导基因沉默开展葡萄抗病育种打下理论基础。