【摘 要】
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本研究中采用全基因组重亚硫酸盐测序分析法对弓形虫PRU株速殖子进行DNA甲基化检测.在体外用HFF细胞培养Pru株弓形虫速殖子,待细胞裂解后收集速殖子,提取基因组DNA.利用全基因组重亚硫酸盐测序分析方法对速殖子全基因DNA甲基化进行分析研究.甲基化C碱基在基因组上的分布包含三种形式(CG,CHG和CHH,其中H代表A或T或C碱基).其中mCG,mCHG,mCHH的量分别为1439b,296b,9
【机 构】
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南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物学系,广州,510515
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第七次代表大会暨第十二次学术研讨会
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本研究中采用全基因组重亚硫酸盐测序分析法对弓形虫PRU株速殖子进行DNA甲基化检测.在体外用HFF细胞培养Pru株弓形虫速殖子,待细胞裂解后收集速殖子,提取基因组DNA.利用全基因组重亚硫酸盐测序分析方法对速殖子全基因DNA甲基化进行分析研究.甲基化C碱基在基因组上的分布包含三种形式(CG,CHG和CHH,其中H代表A或T或C碱基).其中mCG,mCHG,mCHH的量分别为1439b,296b,925b,共计2660b,甲基化形式以mCG为主,主要发生在基因的5’-CG-3序列,平均甲基化水平为0.27％.将编码序列分为7个不同的转录原件:上游区域、第一个外显子、第一个内含子、中间外显子、中间内含子、最后一个外显子、下游区域.分别对不同的转录原件进行甲基化水平分析,结果发现速殖子不同转录原件间DNA甲基化水平差异不显著.本研究初步证实了速殖子阶段存在低水平的DNA甲基化现象,后续的研究重点应放在探讨DNA甲基化在刚地弓形虫不同发育时期虫体相互转化过程中的作用.
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